Unterschied zwischen Gene Cloning und PCR | Gene Cloning vs PCR

Anonim

Schlüsselunterschiede - Klonierung von Genen gegen PCR

Die Synthese vieler Kopien von DNA aus einem spezifischen DNA-Fragment wird DNA-Amplifikation genannt. Es gibt zwei Haupt-DNA-Amplifikationsprozesse, nämlich Gencloning und PCR. Der Hauptunterschied zwischen der Genklonierung und der PCR besteht darin, dass die Gen-Klonierung die Mehrfachkopien eines spezifischen Gens in vivo erzeugt, indem eine rekombinante DNA aufgebaut und innerhalb eines Wirtsbakteriums gezüchtet wird, während die PCR Millionen Kopien eines spezifisches DNA-Fragment in vitro, das wiederholte Denaturierungs- und Synthesezyklen durchläuft.

INHALT

1. Übersicht und Tastendifferenz

2. Was ist Gene Cloning

3. Was ist PCR

4? Seite an Seite Vergleich - Gene Cloning gegen PCR

5. Zusammenfassung

Was ist Gene Cloning?

Die Klonierung von Genen ist eine Technik, die verwendet wird, um ein spezifisches Gen aus der extrahierten genomischen DNA eines Organismus durch die Konstruktion von rekombinanter DNA zu lokalisieren und zu vermehren. Genomische DNA enthält Tausende von verschiedenen Genen, die für Proteine ​​codiert sind. Wenn DNA extrahiert wird, enthält es alle möglichen Gene, die es tragen kann. Die Gencloning-Technik hat den Nachweis eines spezifischen Gens aus der Gesamt-DNA ermöglicht. Das Genklonieren dient daher als wichtiges Werkzeug in der Molekularbiologie.

Die Herstellung einer genomischen Bibliothek eines Organismus ist essentiell beim Genklonieren, wenn es keinen Hinweis auf den Ort des relevanten Gens in der DNA gibt. Eine genomische Bibliothek wird unter Verwendung der folgenden Schritte hergestellt.

Schritt 1: Extraktion der Gesamt-DNA aus einem Organismus, der das gewünschte Gen enthält.

Schritt 2: Restriktionsverdau der extrahierten DNA, um kleine überschaubare Fragmente zu produzieren. Dieser Schritt wird durch Restriktionsendonukleasen erleichtert.

Schritt 3: Auswahl eines geeigneten Vektors und Öffnen der Vektor-DNA unter Verwendung der gleichen Restriktionsendonukleasen. Bakterielle Plasmide werden üblicherweise als Vektoren verwendet, um fremde DNA zu tragen. Plasmide sind kleine DNA-Kreise, die sich in Bakterien befinden.

Schritt 4: Kombinieren der Vektor-DNA und der fragmentierten DNA, um ein rekombinantes DNA-Molekül herzustellen. Dieser Schritt wird von DNA-Ligase gesteuert.

Schritt 5: Übertragung von rekombinanten DNA-Molekülen in Wirtsbakterien. Dieser Schritt ist als Transformation bekannt und wird mit einem Hitzeschock durchgeführt.

Schritt 5: Screening von transformierten Bakterienzellen auf einem Kulturmedium. Am Ende des Transformationsprozesses wird eine gemischte Population von transformierten und nicht-transformierten Wirtszellen erhalten. Als Gen von Interesse umfasst nur in transformierten Wirtszellen.Daher ist es notwendig, transformierte Zellen auszuwählen. Die Auswahl erfolgt mit selektiven Medien, die Antibiotika enthalten. Nur die transformierten Zellen wachsen auf diesem Screening-Medium, was die Selektion ermöglicht.

Schritt 6: Anbau von Bakterien zur Herstellung einer Genbibliothek. In diesem Schritt werden die transformierten Wirtszellen in frisches Kulturmedium eingebracht, das optimale Wachstumsanforderungen liefert. Gesamtkolonien auf den Kulturplatten stellen die genomische Bibliothek dieses Organismus dar.

Schritt 7: Das rekombinante DNA-Molekül, das das Gen von Interesse enthält, muss aus Tausenden von klonierten Fragmenten von rekombinanter DNA gescreent werden. Dies kann durch die Verwendung von Sonden erreicht werden, die das spezifische Gen oder das spezifische Protein aus diesem Gen markieren.

Sobald das interessierende Gen, das die Bakterienkolonie enthält, aus den Gesamtkolonien identifiziert wird, ist es möglich, Millionen Kopien des rekombinanten Plasmids herzustellen, das das Gen enthält.

Gencloning wird verwendet, um Genbibliotheken herzustellen, spezielle Proteine, Vitamine, Antibiotika, Hormone zu produzieren, Genome der Organismen zu sequenzieren und zu kartieren, Was ist PCR?

Polymerase-Kettenreaktion (PCR) ist eine Technik, die eine große Anzahl von Kopien eines bestimmten DNA-Fragments erzeugt. Die exponentielle Amplifikation einer spezifischen DNA-Sequenz wird durch PCR unter

in vitro

Bedingungen erhalten. Diese Technik ist ein sehr leistungsfähiges Werkzeug in der Molekularbiologie, da es eine kleine DNA-Probe in eine nutzbare Menge vermehren kann. PCR wurde von Kary Mullis im Jahr 1983 eingeführt und diese preisgekrönte Erfindung schuf einen großen Fortschritt in der Molekularbiologie. Die PCR-Technik folgt wiederholten PCR-Reaktionen, wie in Fig. 02 gezeigt. Eine PCR-Reaktion besteht aus drei Hauptstufen, die bei drei verschiedenen Temperaturen auftreten; Denaturierung von doppelsträngigem DNA bei 94 999 0 999 C, Annealing der Primer bei 68 999 0 999 C und Strangverlängerung bei 72 999 0 999 C. Wenn die PCR durchgeführt wird, sollte daher die Temperaturschwankung für eine ordnungsgemäße Replikation in hohem Maße beibehalten werden. Die PCR wird in einem PCR-Gerät in PCR-Röhrchen durchgeführt. PCR-Röhrchen werden mit korrekten PCR-Mischungen beladen, die Matrizen-DNA, Taq-Polymerase, Primer, dNTPs und Puffer enthalten. Die Denaturierung doppelsträngiger Proben-DNA in einzelsträngige DNA erfolgt durch Aufbrechen der Wasserstoffbrücken zwischen komplementären Basen bei 94-98 999 0 999 C. Dann werden einzelne Stränge der Matrizen-DNA für Primer exponiert. Es sollte ein Paar Primer (vorwärts und rückwärts) vorgesehen werden, und sie sollten thermostabil sein, um hohe Temperaturen zu tolerieren. Primer sind einzelsträngige kurze DNA-Sequenzen, die zu den Enden des Ziel-DNA-Fragments komplementär sind. Synthetische Primer werden in der PCR verwendet. Primer binden mit den komplementären Basen der Proben-DNA und initiieren die Synthese eines neuen Strangs. Dieser Schritt wird durch ein Enzym katalysiert, das Taq-Polymerase genannt wird; ein thermostabiles DNA-Polymerase-Enzym, isoliert aus Thermus auqaticus

. Wenn Primer und Nukleotide (Bausteine) verfügbar sind, konstruiert die Taq-Polymerase den neuen DNA-Strang, der zu der Template-DNA komplementär ist.Am Ende des PCR-Programms wird ein amplifiziertes DNA-Fragment unter Verwendung von Gelelektrophorese beobachtet. Wenn eine weitere Analyse erforderlich ist, wird das PCR-Produkt aus dem Gel gereinigt. PCR ist sehr nützlich für die Diagnose und Überwachung genetischer und erworbener Krankheiten, die Identifizierung von Kriminellen (auf dem Gebiet der Forensik), die Untersuchung der Struktur und Funktion eines gezielten DNA-Segments, die Sequenzierung und Kartierung von Genomen von Organismen usw. Die PCR ist zu einer Routinelabtechnik in medizinischen und molekularbiologischen Forschungslabors unter Wissenschaftlern geworden, da sie eine Vielzahl von Anwendungen aufweist. Figure_2: Polymerase Chain Reaction Was ist der Unterschied zwischen Gene Cloning und PCR? - diff Artikel Mitte vor Tabelle -> Gene Cloning vs PCR Gene Klonen ist der Prozess der Herstellung mehrerer Kopien eines spezifischen Gens in vivo durch rekombinante DNA und Transformieren in ein Wirtsbakterium. Die PCR-Technik erzeugt multiple Kopien einer bestimmten DNA-Sequenz in vitro

durch wiederholte Zyklen von PCR-Reaktionen.

Erfordernis, rekombinante DNA zu konstruieren

Es wird rekombinante DNA produziert, um das Gen zu lokalisieren.

Es wird keine rekombinante DNA produziert.

Arbeitsbedürftigkeit

Dieser Prozess ist arbeitsintensiv. Intensive Arbeit ist nicht erforderlich. In vivo oder In-vitro-Verfahren Die Konstruktion von rekombinanter DNA ist in vitro und die Amplifikation der DNA
in vivo
. Die Amplifikation der DNA erfolgt in vitro vollständig
.
Zusammenfassung - Gene Cloning gegen PCR Gene Klonierung und PCR sind zwei Methoden für die DNA-Amplifikation. PCR ist ein
in vitro
-Prozess, bei dem mehrere Kopien der DNA eines bestimmten DNA-Fragments ohne Verwendung von rekombinanter DNA und einem Wirtsorganismus hergestellt werden. Das Klonieren von Genen ist in erster Linie ein in vivo -Prozess, der durch Konstruktion von rekombinanter DNA zu mehrfachen Kopien eines interessierenden Gens im Wirtsorganismus führt. Dies ist der Unterschied zwischen Gene Klonen und PCR. Referenz: 1. Griffiths, Anthony JF. Klonen eines spezifischen Gens. "Moderne genetische Analyse. U.S. National Library of Medicine, 01. Januar 1999. Web. 22. Februar 2017 2. Polymerase-Kettenreaktion (PCR). "Nationales Zentrum für Biotechnologie Information. U.S.-Nationalbibliothek der Medizin, n. d. Web. 22 Feb. 2017 Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. "Abbildung 17 01 06" Von CNX OpenStax - (CC BY 4. 0) über Commons Wikimedia

2. "PCR" von Madprime - Eigene Arbeit (CC BY-SA 3. 0) über Commons Wikimedia