Unterschied zwischen VNTR und STR | VNTR vs STR

Schlüsselunterschiede - VNTR vs STR

DNA-Studien haben einen immensen Nutzen für das Verständnis und die Bestimmung phylogenetischer Beziehungen, die Diagnose genetischer Erkrankungen und die Kartierung des Genoms des Organismus. Mehrere mit DNA-Analyse verbundene Techniken werden zur Identifizierung eines bestimmten Gens oder einer DNA-Sequenz in einem Pool unbekannter DNA verwendet. Sie sind als genetische Marker bekannt. Genetische Marker werden in der Molekularbiologie verwendet, um genetische Variationen zwischen Individuen und Spezies zu identifizieren. Variable Anzahl Tandemwiederholung (VNTR) und kurze Tandemwiederholung (STR) sind zwei Arten von genetischen Markern, die Polymorphismen bei Individuen zeigen. Beide Typen sind nichtkodierende repetitive DNA, die Tandem-Repeats sind. Sie sind von Kopf bis Schwanz in Chromosomen angeordnet. VNTR ist ein Abschnitt des Genoms, bei dem die kurze Nukleotidsequenz mehrere Male wiederholt wird. STR ist ein weiterer Abschnitt der DNA innerhalb des Genoms, der als Wiederholungseinheiten organisiert ist, die aus zwei bis dreizehn Nukleotiden in Hundertmal bestehen. Der Hauptunterschied zwischen VNTR und STR ist die Anzahl der Nukleotide in einer sich wiederholenden Sequenz. Wiederholende Einheiten von VNTR bestehen aus 10 bis 100 Nukleotiden, während sich wiederholende Einheiten von STR aus 2 bis 13 Nukleotiden bestehen. VNTR und STR werden in forensischen Studien häufig verwendet.

INHALT

1. Übersicht und Tastendifferenz

2. Was ist VNTR

3? Was ist STR

4. Ähnlichkeiten zwischen VNTR und STR

5. Seite an Seite Vergleich - VNTR vs STR in Tabellenform

6. Zusammenfassung

Was ist VNTR?

Ein Tandem-Repeat ist eine kurze DNA-Sequenz, die sich von Kopf bis Schwanz an einem bestimmten Chromosomen-Locus wiederholt. Innerhalb der Tandemwiederholung gibt es keine andere Sequenz oder kein Nukleotid. Es gibt mehrere Arten von Tandem-Wiederholungen im Genom. VNTR ist eine Art von Tandemwiederholung unter ihnen, die Wiederholungseinheiten aufweist, die 10 bis 100 Nukleotide ausmachen. VNTR ist eine Art Minisatellit. Diese Tandem-Wiederholungen können in vielen Chromosomen gefunden werden. Sie sind innerhalb des menschlichen Genoms durchsetzt und befinden sich vorwiegend in den subtelomeren Bereichen der Chromosomen.

VNTRs zeigen Tandem-Repeat-Polymorphismus bei Individuen. Die Länge der VNTR an einem bestimmten Ort des Chromosoms ist bei Individuen aufgrund der Variation der Anzahl der sich wiederholenden Einheiten, die in diesem DNA-Abschnitt organisiert sind, sehr variabel. Daher kann VNTR als ein leistungsfähiges Werkzeug bei der Identifizierung von Individuen verwendet werden, und die VNTR-Analyse wird in vielen Bereichen verwendet, einschließlich Genetik, Biologieforschung, Forensik und DNA-Fingerdruck.VNTRs waren die ersten genetischen Marker, die zur Quantifizierung der Knochenmarktransplantation verwendet wurden. VNTRs waren auch die ersten polymorphen Marker, die beim DNA-Profiling in der Forensik verwendet wurden.

Abbildung 9: Variation der VNTRs in sechs Individuen

Die VNTR-Analyse wird über Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus gefolgt von Southern-Hybridisierung durchgeführt. Daher benötigt es vergleichsweise eine große DNA-Probe. Die VNTR-Profilinterpretation ist ebenfalls problematisch. Aufgrund dieser Einschränkungen wurde die Verwendung von VNTR in der forensischen Genetik eingeschränkt und durch eine STR-Analyse ersetzt.

Was ist STR?

STR ist ein hoch repetitiver DNA-Abschnitt, der aus zwei bis dreizehn Nukleotid-Wiederholungseinheiten besteht, die in einer Tandem-Art organisiert sind. STR ist ähnlich wie VNTR. Sie variiert jedoch von VNTR von der Anzahl der Nukleotide in einer sich wiederholenden Sequenz und der Anzahl der Wiederholungen. STR ist eine Art von Mikrosatelliten.

STR-Analyse bei der Messung der genauen Anzahl der sich wiederholenden Einheiten. STRs sind bei Individuen sehr variabel, ähnlich wie VNTs. STR-Profile unterscheiden sich von Person zu Person. Daher wird die STR-Analyse in der Molekularbiologie verwendet, um spezifische Loci auf der DNA von zwei oder mehr Proben zu vergleichen. Daher gelten STRs als leistungsfähige genetische Marker in der Molekularbiologie. Es ist ein ausgezeichnetes Werkzeug zur Identifizierung von Individuen aufgrund ihres hohen Polymorphismus und relativ kurzer Länge.

Gegenwärtig sind STRs das am häufigsten verwendete genetische Polymorphismus-Werkzeug in der forensischen Genetik. Die meisten forensischen Fallbeispiele beinhalten die polymorphe STR-Analyse. STR-Loci sind im gesamten Genom verbreitet. Es gibt Tausende von STRs in Chromosomen, die in der forensischen Analyse verwendet werden können. Die STR-Analyse beinhaltet keinen Restriktionslängenpolymorphismus wie die VNTR-Analyse. STR-Analyse schneidet DNA nicht mit Restriktionsenzymen. Spezifische Sonden werden verwendet, um gewünschte Regionen an DNA anzubinden, und unter Verwendung der PCR-Technik werden die Längen der STR bestimmt.

Abbildung 02: STR-Variation zwischen den Proben

Was sind die Ähnlichkeiten zwischen VNTR und STR?

VNTR und STR sind nicht kodierende DNA.

Beide sind Tandem-Wiederholungen.
Beide zeigen Polymorphismus bei Individuen aufgrund der unterschiedlichen Länge der DNA-Sektion.
Beide werden als leistungsfähige genetische Marker beim DNA-Fingerprinting und in forensischen Studien eingesetzt.
Was ist der Unterschied zwischen VNTR und STR?

- diff Artikel Mittel vor Tabelle ->

VNTR vs STR

VNTR ist ein nicht-codierende repetitiver DNA, die eine kurze Nukleotidsequenz in einer Tandem-Weise wiederholt hat.
STR ist ein hoch repetitiver DNA-Abschnitt, der aus zwei bis dreizehn Nukleotid-Wiederholungseinheiten besteht, die in einer Tandem-Art organisiert sind.	Größe
VNTRs sind größer als STRs.
STRs sind kleiner als VNTRs.	Anzahl der Nukleotide in sich wiederholender Sequenz
Die Wiederholungseinheit von VNTR besteht aus 10 bis 100 Nukleotiden.
Die sich wiederholende Einheit von STR besteht aus 2 bis 13 Nukleotiden.	Zusammenfassung - VNTR vs STR

VNTR und STR sind zwei leistungsfähige genetische Marker in der Molekularbiologie, insbesondere auf dem Gebiet der forensischen Genetik.VNTR ist eine Art Minisatellit und STR ist ein Mikrosatellit. VNTR und STR sind nichtkodierende, hoch repetitive DNA. Sie sind Tandem-Wiederholungen. Die allgemeine Struktur von VNTR und STR ist dieselbe. Die Anzahl der Nukleotide in der sich wiederholenden Sequenz und der Länge ist jedoch unterschiedlich. VNTR hat sich wiederholende Sequenzen, die aus 10 bis 100 Nukleotiden bestehen. STR hat sich wiederholende Sequenzen, die aus 2 bis 13 Nukleotiden bestehen. Dies ist der Unterschied zwischen VNTR und STR.

PDF-Version von VNTR gegen STR herunterladen

Sie können die PDF-Version dieses Artikels herunterladen und gemäß den Zitierhinweisen für Offline-Zwecke verwenden. Bitte hier PDF-Version herunterladen Unterschied zwischen VNTR und STR.

Referenzen:

1. "Die Wissenschaft der forensischen Genetik. "CRG - Rat für verantwortungsvolle Genetik. N. p., n. d. Web. Hier verfügbar. 10. Juli 2017.

2. "STR-Analyse. "Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22. März 2017. Web. Hier verfügbar. 10. Juli 2017.

Bild mit freundlicher Genehmigung: